Nghiên cứu đặc điểm gen H5 và N1 của virus cúm A/H5N1 phân lập tại Việt Nam để tạo nguồn nguyên liệu sản xuất vaccine thế hệ mới

Thứ sáu - 11/03/2016 07:22
  Tên đề tài luận án tiến sĩ: “Nghiên cứu đặc điểm gen H5 và N1 của virus cúm A/H5N1 phân lập tại Việt Nam để tạo nguồn nguyên liệu sản xuất vaccine thế hệ mới”.
Chuyên ngành: Hóa sinh học
Mã số: 62 42 30 15
Họ và tên NCS: Nguyễn Thị Bích Nga
Khoá: 2008-2011
Người hướng dẫn khoa học:
1. PGS.TS. Lê Thanh Hòa
2. PGS.TS. Lương Thị Hồng Vân
Đơn vị đào tạo: Trường Đại học Khoa học
Cơ sở đào tạo: Đại học Thái Nguyên
NHỮNG KẾT QUẢ MỚI CỦA LUẬN ÁN
1. Đây là công trình giải trình tự toàn bộ gen H5 và N1 theo cặp trong hệ gen của từng chủng của virus cúm A/H5N1 đại diện của một số địa phương tại Việt Nam được phân lập theo thời gian từ năm 2004 – 2011.
2. Vùng chuỗi nối HA1-HA2 trong polypeptide H5 suy diễn có motif là (-RRRKK-) hoặc (-RRRK-) hoặc (-GRRKK-) và biến đổi ở gen N1 cho thấy các chủng virus được phân lập trong nghiên cứu đã phản ánh tương đối đầy đủ những biến đổi quan trọng của quần thể virus cúm A/H5N1 lưu hành và gây bệnh tại Việt Nam
3. Hai chủng DkQT801-2011 và DkQT0802-2011, thu nhận tháng 7/2011, được xác định nằm trong nhóm kháng nguyên mới 2.3.2.1, hiện đã gây nên các ổ dịch cúm A/H5N1 tại một số tỉnh phía Bắc. Việc giải mã và phân tích gen H5 và N1 của 2 chủng thuộc clade 2.3.2.1 này góp phần tìm hiểu biến đổi mới nhất của virus cúm A/H5N1 gây bệnh tại nước ta. 
4. Các chủng cúm A/H5N1 đã thực hiện glycosyl hoá tại 7 vị trí trong chuỗi polypeptide H5. Sự thay đổi ở vị trí thứ III (aa 170 - 172) khá đặc biệt, đó là amino acid NST ở phân dòng Quảng Đông, còn ở phân dòng Phúc Kiến là NNT, trong khi các chủng mới phân lập thuộc clade 2.3.2.1 đã biến đổi thành DNA.
5. Chuỗi gen N1 ở tất cả các chủng trong nghiên cứu có kích thước là 1350 nucleotide. Các chủng virus cúm A/H5N1 từ khi xuất hiện tại Việt Nam đến nay không có đột biến lớn khác biệt các dòng N1 như ở giai đoạn các năm 1996 - 1997 và 1997 - 2003,  mà các đột biến chủ yếu vẫn tập trung vào một dòng gen N1 đã tiến hoá.
6. Có sự đa nhiễm các clade của virus cúm gia cầm ở từng thời điểm. Từ khi xuất hiện tại Việt Nam đến nay, các chủng trong nghiên cứu đã được xác định thuộc 4 nhóm clade, đó là: clade 1, clade 1.1, clade 2.3.2.1 và clade 2.3.4.3, trong đó clade 1.1 (từ 2008) và clade 2.3.2.1 (từ 2011) được coi là mới xuất hiện tại Việt Nam.
CÁC ỨNG DỤNG, KHẢ NĂNG ỨNG DỤNG TRONG THỰC TIỄN HOẶC NHỮNG VẤN ĐỀ CÒN BỎ NGỎ CẦN TIẾP TỤC NGHIÊN CỨU
Hiện nay các nguyên liệu ADN tái tổ hợp (ADN plasmid) của gen H5 và N1 đã được lưu giữ trong vector tách dòng. Có thể sử dụng từ các nguyên liệu này cho các nghiên cứu tiếp theo trong việc sản xuất các vaccine thế hệ mới.
Cần phân tích số lượng cỡ mẫu nhiều hơn về tính ổn định của các dòng gen nhằm chọn lọc đúng nguồn gen thích hợp làm nguyên liệu cho kiến tạo chế phẩm mới đặc biệt vaccine thế hệ mới ở Việt Nam.
Giải mã gen H5 và N1 và toàn bộ hệ gen của một số chủng mới (thuộc clade 2.3.2.1 của năm 2011 - 2012) để phân tích so sánh với các chủng cùng và khác nhóm kháng nguyên để có cơ sở dữ liệu đánh giá biến đổi di truyền cúm A/H5N1 hiện nay và định hướng tương quan miễn dịch và vaccine phòng bệnh.

INFORMATION OF DISSERTATION
Research title“Molecular characterization of hemagglutinin and neuraminiadse of the avian influenza virus A/H5N1 isolated in Vietnam for new generation vaccine development”.
Speciality: Biochemistry
Code: 62 42 30 15
Ph.D candidate: Nguyen Thi Bich Nga
Scientific supervisors:
1. Assoc. Prof. Le Thanh Hoa
2. Assoc. Prof. Luong Thi Hong Van
Training Institution: College of Sciences, Thai Nguyen University
 
THE NEW SCIENTIFIC FINDINGS
 1. This dissertation describes the sequencing and comparative analysis of the complete hemagglutinin (H5) and neuraminidase (N1) of each strain of the A/H5N1 viruses isolated from provinces in Vietnam during 2004 – 2011.
2. The connecting site (protease cleavage) between HA1-HA2 in H5 polypeptide has the motif (-RRRKK-) or (-RRRK-) or (-GRRKK-); and mutations in N1 showed that our strains during the period 2004-2011.reflected full characteristics of the important A/H5N1 populations circulating and causing disease in Vietnam.
3. Two strains DkQT801-2011 and DkQT0802-2011, isolated in July, 2011, were classified to clade 2.3.2.1, currently causing outbreaks of A/H5N1 in severalNorthern provinces. The analysis of H5 and N1 genes of these two strains ofclade 2.3.2.1 would contribute to our understandings of the latest changes in the population of the A/H5N1 influenza viruses in our country.
4. The A/H5N1 viruses havea 7 sites of glycosylation in the H5 polypeptide. The change in position III (aa 170-172) is quite special, that it is NST in the strains of the Guangdong, and NNT in the Fujian lineage, while the recently isolated strains of clade 2.3.2.1 has been changed into DNA.
5. The total length of all N1 genes in all strains in our study was 1350nucleotides. The influenza A/H5N1 virus strains, from introduction in Vietnam so far, no significant change in N1 as differences appeared in the period 1996 - 1997 and 1997-2003, that the mutations are mainly focused on one N1 lineage of its evolution.
6. There was multiple infected clades the avian influenza virus in each period. Since the first detection of the A/H5N1 in Vietnam, among our studied strains, there were 4 clades determined, ie., clade 1, clade 1.1, clade 2.3.2.1 and clade 2.3.4.3, of which clade 1.1 (since 2008) and clade 2.3.2.1 (since 2011) have recently emerged in Vietnam.
 
PRACTICAL APPLICABILITY AND THE NEEDS FOR FURTHER STUDIES
Currently, a number of hemagglutinin and neuraminidase segments amplified from periodically isolated A/H5N1 viruses were cloned in plasmids for maintenance the antigenic source for construction of new generation vaccine master seed strains.
Larger number and newly emerged isolates should be obtained and analyzed for assessment of genetic characteristics of the A/H5N1 viruses. This is the base for the right selection of the suitable hemagglutinin and neuraminidase genes for construction of new generation vaccine development in Vietnam.
Obtaining the sequence for the hemagglutinin and neuraminidase genes and the entire genome of emerged strains of clade 2.3.2.1 during 2011 – 2012 should be carried out and comparative analysis of sequences for genetic variation among strains would provide data for evaluation genetic change and direction of vaccine and immunization policy in Vietnam.

 Nội dung đính kèm:
- Tóm tắt nội dung luận án (Tiếng Việt);
- Tóm tắt nội dung luận án (Tiếng Anh);
- Nội dung luận án (Luận án)

Hướng dẫn tải file:


- Bấm vào link bên dưới, đợi 5s. Click vào nút: Bỏ qua quảng cáo. Chi tiết xem thêm tại đây: https://www.sinhhoc.edu.vn/biology/index.php/about/Huong-dan-su-dung-Website.html
 
Mật khẩu file:  sinhhoc.edu.vn
 
Hướng dẫn mở file:
- Cách đổi đuôi file: https://www.sinhhoc.edu.vn/biology/index.php/about/Huong-dan-cach-thay-doi-duoi-file-trong-Windows-XP-7-8.html
- Tải file về, bấm chuột phải vào file, chọn Rename. Giữ nguyên tên file, đổi 2 kí tự HT thành ar rồi dùng Winrar (phiên bản Winrar 5.0 trở lên) giải nén với mật khẩu ở trên. Nếu có thắc mắc liên hệ: 0975.421.186.

Link tải: http://www.mediafire.com/?n7fhg09az0ym3
Trân trọng!
Chú ý: Việc đăng lại bài viết trên ở website hoặc các phương tiện truyền thông khác mà không ghi rõ nguồn https://wWw.YSinhHoc.vn là vi phạm bản quyền

Tổng số điểm của bài viết là: 5 trong 1 đánh giá

Xếp hạng: 5 - 1 phiếu bầu
Click để đánh giá bài viết

  Ý kiến bạn đọc

Những tin mới hơn

Những tin cũ hơn

Thảo luận

Hướng dẫn sử dụng Website

Nhằm giúp quý thầy, cô giáo cùng các bạn học sinh, sinh viên và những ai quan tâm đến Sinh học có thể dễ dàng sử dụng Website wWw.SinhHoc.edu.vn để tra cứu, tìm kiếm tài liệu, giáo trình, bài giảng v.v...., cũng như một số lưu ý khi sử dụng tài liệu từ websitel; chúng tôi sẽ đưa ra cấu trúc dữ liệu...

Thăm dò ý kiến

Bạn muốn Website cung cấp thêm ebook về lĩnh vực?

Tiện ích
 Trình duyệt Web

 Firefox


 Trình duyệt Web

 Google Chorme


 Bộ gõ Unikey

 Unikey 4.2 RC4


 Bộ gõ Vietkey

 Vietkey 2007


 Bộ gõ tiếng Việt

 Gõ tiếng Việt


 Tăng tốc tải file

 IDM 6.25


 TeamviewerHỗ trợ từ xa

 Team Viewer v11


 Đọc PDF

 PDF Reader v7.3.0.0118


 Cắt và nối file *.001 ..

 FFSJ


 Nén & Giải nén

 WinRAR 5.31

Monkey Junior
Bạn đã không sử dụng Site, Bấm vào đây để duy trì trạng thái đăng nhập. Thời gian chờ: 60 giây